в tga есть только альфа-канал, для начала нужно открыть вкладку с каналами и сделать_видимым\создать канал Alpha: Окно|Каналы Допустим у нас есть картинка с прозрачностью
выбираем инструмент выделения и жмём правой кнопкой мыши|Загрузить выделение
создаём альфа канал, заливаем белым выделение в канале.
часть котэ больше не закрашена красным, это и есть видимая часть изображения.
слегка красные, это полупрозрачные части.
как альфа канал в прозрачность переделать не знаю, не было необходимости.
вобще в интернете полно всяких уроков по фотошопу и википедию ещё никто не закрывал